2018年4月5日，浙江大学基础医学院郭国骥教授团队在《基因组生物学》（Genome Biology）杂志发表题为“Mapping human pluripotent stem cell differentiation pathways using high throughput singlecell RNAsequencing”的文章（https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s1305901814260）。他们利用高通量的单细胞分析平台对人多能干细胞拟胚体分化系统进行了分析，绘制了人多能干细胞的体外谱系分化图谱。他们首次使用优化的高通量微流控芯片C1 HT IFC来捕获单细胞样品用于单细胞转录组测序，该平台的优势在于测序通量和测序深度都较高，每次可分析多达800个细胞，并且每个细胞能检测到约5000个基因。
           1998年Thomson实验室首次报道从人早期囊胚中分离出人多能干细胞，这些细胞具有自我增殖和多向分化能力，可以分化成为人体各种组织细胞，对基础研究和临床疾病的治疗都具有重大意义。研究人员根据发育生物学原理和体外诱导优化试验，基本建立了人多能干细胞（包括胚胎干细胞和诱导多能干细胞）向三个胚层（外胚层、中胚层和内胚层）的分化体系。但是大部分的分化方案仍然面临分化效率低下和细胞功能缺陷等问题。郭国骥教授团队通过单细胞分析，在人多能干细胞分化产生的拟胚体中发现了三胚层多种组织细胞的前体，包括神经、肌肉、内皮、肝脏、上皮组织等。通过时序性分析描绘出这些前体细胞分化过程中动态的基因变化，揭示分化过程中关键的调控基因，有助于加深对早期胚胎谱系分化分子通路的了解以及促进分化方案的优化。
           韩晓平副教授和陈海德博士为论文共同第一作者，哈佛大学袁国丞教授和浙江大学陈海德博士为论文共同通信作者。研究获得了国家自然科学基金和中央高校基本业务费资助。