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浙江大学学报(农业与生命科学版). 2018 (5): 515-648.
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浙江及周边地区猪流行性腹泻病毒S基因分子特征分析
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单颖, 刘子琦, 施杏芬, 李国炜, 陈聪, 罗浩, 刘亚杰, 方维焕, 李肖梁
浙江大学学报(农业与生命科学版). 2018 (5): 610-618.
DOI: 10.3785/j.issn.1008-9209.2017.06.231
对2013 年4 月至2017 年4 月间浙江省及周边24 个地区共282 份病料进行猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)、轮状病毒A型(porcine groupArotavirus, GARV)、猪δ冠状病毒(porcine deltacoronavirus, PDCoV)和猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus, TGEV)等病原的检测,并选取其中的16份PEDV阳性样品进行S基因克隆和序列分析。结果显示:PEDV的检出率为64.89%(183/282),GARV为0.35%(1/282),PDCoV为4.25%(12/282),而未检出TGEV;PEDV在11月1 日至次年4 月1 日间的累计检出率为74%,其余时间段的累计检出率为26%。对PEDV的S蛋白进行分子演化分析表明,PEDV可分为3 个群,其中16 份阳性样品均位于Ⅲ群,与疫苗毒株CV777、SM98 和DR13 株相比,核苷酸同源性为93.6%~95.2%,氨基酸同源性为92.4%~94.9%。16 份PEDV阳性样品与中国PEDV的CV777疫苗毒株相比,形成了3个新的N-糖基化位点,破坏了1个N-糖基化位点。综上表明,当前仔猪腹泻主要病原为PEDV变异株,防控猪流行性腹泻需要注意季节的变化,也需要加快流行株疫苗的开发。
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