浙江大学学报(工学版), 2023, 57(12): 2439-2447 doi: 10.3785/j.issn.1008-973X.2023.12.011

计算机技术

基于缪勒矩阵显微图像的微塑料和微藻分类

卢小刚,, 崔炜, 熊志航, 张华峰, 廖然,

1. 长江大学 物理与光电工程学院,湖北 荆州 434023

2. 清华大学深圳国际研究生院,广东 深圳 518055

3. 佛山科学技术学院 物理与光电工程学院,广东 佛山 528231

Classification of microplastics and microalgae based on Mueller matrix microscopic images

LU Xiao-gang,, CUI Wei, XIONG Zhi-hang, ZHANG Hua-feng, LIAO Ran,

1. School of Physics and Optoelectronic Engineering, Yangtze University, Jingzhou 434023, China

2. Tsinghua Shenzhen International Graduate School, Shenzhen 518055, China

3. School of Physics and Optoelectronic Engineering, Foshan University, Foshan 528231, China

通讯作者: 廖然,男,副教授. orcid.org/0000-0002-3088-2230. E-mail: liao.ran@sz.tsinghua.edu.cn

收稿日期: 2023-02-23  

基金资助: 国家自然科学基金资助项目(61975088, 62275141);深港联合项目(SGDX20201103095403017)

Received: 2023-02-23  

Fund supported: 国家自然科学基金资助项目(61975088,62275141);深港联合项目(SGDX20201103095403017)

作者简介 About authors

卢小刚(1997—),男,硕士生,从事缪勒显微镜偏振成像研究.orcid.org/0000-0002-3167-1187.E-mail:2395639962@qq.com , E-mail:2395639962@qq.com

摘要

使用缪勒矩阵显微镜测量2种微塑料(聚氯乙烯、尼龙6)和2种微藻(多芒藻、衣藻). 使用缪勒矩阵显微镜进行微塑料和微藻分类,讨论影响这种分类方法的多种因素,提出提高分类准确率的可能方案. 利用缪勒矩阵显微镜高通量地测量大视野范围内所有颗粒物的缪勒矩阵,由缪勒矩阵计算得到多个偏振参数,将所得偏振参数作为表征颗粒物物理性质的特征值,并进一步借助前馈神经网络实现对样品分类. 实验结果表明,利用缪勒矩阵图像数据能够成功进行微塑料和微藻分类,分类准确率均超过80%,由此验证了利用缪勒矩阵显微镜对水中微塑料和微藻进行分类的可行性.

关键词: 缪勒矩阵显微镜 ; 缪勒矩阵 ; 微塑料 ; 微藻 ; 颗粒物分类

Abstract

Two categories of microplastics (polyvinyl chloride and nylon 6) and two categories of microalgae (Golenkinia and Chlamydomonas) were measured by the Mueller matrix microscope. Mueller matrix microscope was used to classify microplastics and microalgae, and the factors affecting the mothod of this classification were discussed, and the potential solutions to improve the accuracy rate of classification were proposed. Mueller matrix microscope was used to high-throughput measure the Mueller matrix of all particles within a large field of view. Then, multiple polarization parameters were calculated from the Mueller matrix, and the polarization parameters were used as characteristic values to characterize the physical properties of particles. Further, the feedforward neural network was used to classify the samples. Experimental results show that the Mueller matrix image can successfully classify microplastics and microalgae with an accuracy of more than 80%, and the feasibility of using Mueller matrix microscope to classify microplastics and microalgae in water was confirmed.

Keywords: Mueller matrix microscope ; Mueller matrix ; microplastics ; microalgae ; classification of particles

PDF (1759KB) 元数据 多维度评价 相关文章 导出 EndNote| Ris| Bibtex  收藏本文

本文引用格式

卢小刚, 崔炜, 熊志航, 张华峰, 廖然. 基于缪勒矩阵显微图像的微塑料和微藻分类. 浙江大学学报(工学版)[J], 2023, 57(12): 2439-2447 doi:10.3785/j.issn.1008-973X.2023.12.011

LU Xiao-gang, CUI Wei, XIONG Zhi-hang, ZHANG Hua-feng, LIAO Ran. Classification of microplastics and microalgae based on Mueller matrix microscopic images. Journal of Zhejiang University(Engineering Science)[J], 2023, 57(12): 2439-2447 doi:10.3785/j.issn.1008-973X.2023.12.011

水环境安全日益受到人们重视. 由微塑料造成的环境污染成为人们关注的新热点. 微塑料通常是指粒径小于5 mm的塑料制品或塑料碎屑[1];它在环境中的残留浓度高且容易被生物摄入,对生物体的健康构成潜在威胁[2]. 我国水体中微塑料污染问题比较严重,部分水体中检测到的微塑料浓度较高[3]. 微藻是水生态系统的主要初级生产者,在水生食物网的物质转移和能量流动中发挥着重要作用[4]. 微藻在食品生产、医药研究、生物能源等领域具有很大的商业价值[5]. 有害微藻过度增殖会引发水华,导致水中鱼类中毒甚至死亡,严重污染水环境[6].

探测微塑料、微藻是水资源开发和水环境污染监测的重要组成部分. 光学探测方法具有无损伤、非接触、信息量大等优势[7],多种光学仪器被用于原位监测水体悬浮颗粒物的变化. 激光粒度仪LISST-200X基于激光前向散射原理,用于测量水体前向散射小角度分布,可获取颗粒物的粒径分布和浓度[8]. 吸收系数和衰减系数是水体固有光学量,水体吸收-衰减测量仪AC-S能同时测量这2个系数,为水体颗粒物分析和水色遥感提供基础参数[9]. 浊度计通过测量悬浮颗粒物的散射光测量水体浊度,水体浊度常用于评估悬浮颗粒物浓度[10]. 以上光学仪器进行的是水中大量颗粒物的统计测量,难以对颗粒物细致分类. 光学显微镜通过观察颗粒物大小、颜色、形态等特征对颗粒物进行分类,是微藻、微塑料观察和鉴定的常用仪器[11]. 普通光学显微镜在识别某些形态特征相似的微藻或微塑料时,不仅准确度较低[12],而且分析过程耗时,鉴定种类需要专业分类学家在观察大量相关图集的基础上,通过观察颗粒物的形态特征进行分类鉴定[13]. 流式细胞仪通过流体动力学液流系统,让颗粒物依次通过探测区域,测量单个颗粒物的散射光强和荧光强度,据此对颗粒物进行分类[14]. 由于自然水体中颗粒物的种类复杂、形态差异大且粒径分布广,导致液流系统容易堵塞,影响了流式细胞仪的广泛使用[15]. 偏振是光的基本属性[16]. 用偏振光照射颗粒物后,出射光的偏振态对颗粒物的微观结构尤为敏感. 偏振光技术能够兼容传统的非偏振光学仪器,在传统的光学显微镜上添加偏振器件可以构成缪勒矩阵显微镜,测量样品的缪勒矩阵[17]. 缪勒矩阵表征样品偏振光学属性,如退偏、双折射和细微结构取向等[18]. Li等[12]使用缪勒显微镜进行海藻成像和分类,证明了利用缪勒矩阵图像的分类准确度优于光强图像. Liu等[19]使用缪勒矩阵显微镜进行形态相似的微藻的有效分类,实现了海洋微藻的高通量分类. 此处的通量是指同一视野中同时测量的微藻数量,与流式细胞仪中定义的通量(单位时间内经过检测区的颗粒物数量)不同[14,19]. 缪勒矩阵显微镜作为非标记、定量化、无损伤的检测工具,在水体颗粒物分类领域显示出了技术优势和应用潜力.

本研究使用缪勒矩阵显微镜进行水中微藻和微塑料的测量,讨论影响分类结果的因素,包括不同颗粒物所在像素的处理方法,颗粒物运动伪影,缪勒矩阵显微镜在不同成像深度的对焦等. 1)以2种常见微塑料和2种微藻为样品,利用缪勒矩阵显微镜高通量地测量大视野范围内所有颗粒物的缪勒矩阵;2)由缪勒矩阵计算得到的多个偏振参数来表征颗粒物的物理性质;3)借助前馈神经网络的深度学习方法对颗粒物进行分类.

1. 缪勒矩阵显微方法

1.1. 实验原理

光的偏振态可以采用斯托克斯向量 $ \boldsymbol{S} $描述, $\boldsymbol{S}={\left[{S}_{ 0},\;{S}_{ 1},\;{S}_{ 2},\;{S}_{ 3}\right]}^{\mathrm{T}}$,其中 $ {S}_{ 0} $为总光强, $ {S}_{ 1} $为水平和垂直线偏振分量的强度差, $ {S}_{ 2} $为±45°方向线偏振分量的强度差, $ {S}_{ 3} $为右旋与左旋圆偏振分量的强度差[20]. 当照明光穿过样品时,

$ {\boldsymbol{S}}_{\mathrm{o}\mathrm{u}\mathrm{t}}=\boldsymbol{M}\times {\boldsymbol{S}}_{\mathrm{i}\mathrm{n}} , \begin{array}{c}\boldsymbol{M}=\left[\begin{array}{l}{M}_{11}\;\;{M}_{12}\;\;{M}_{13}\;\;{M}_{14}\\ {M}_{21}\;\;{M}_{22}\;\;{M}_{23}\;\;{M}_{24}\\ {M}_{31}\;\;{M}_{32}\;\;{M}_{33}\;\;{M}_{34}\\ {M}_{41}\;\;{M}_{42}\;\;{M}_{43}\;\;{M}_{44}\end{array}\right]. \end{array} $

式中: $ {\boldsymbol{S}}_{\mathrm{o}\mathrm{u}\mathrm{t}} $为透射光的斯托克斯向量; $ {\boldsymbol{S}}_{\mathrm{i}\mathrm{n}} $为照明光的斯托克斯向量; $\boldsymbol{M}\mathrm{为}\mathrm{缪}\mathrm{勒}\mathrm{矩}\mathrm{阵}$,它包含了样品的所有偏振信息,16个阵元可以表征多种偏振效应;其中 $ {M}_{11} $为样品的光强信息, $ {M}_{22} $$ {M}_{33} $为样品的退偏特征, $ {M}_{12} $$ {M}_{13} $为样品的二向色性特征, $ {M}_{24} $$ {M}_{34} $$ {M}_{42} $$ {M}_{43} $为样品的双折射特征. 通过改变入射光和出射光的偏振态,求解线性方程组可以得到样品的缪勒矩阵. 根据定义,至少需要4次测量才能得到完整的缪勒矩阵.

缪勒矩阵携带颗粒物丰富的微观结构特征信息,可以完备描述颗粒物偏振光学性质,对散射颗粒物的光学性质(包括折射率、吸收、双折射、二向色性等)、形态(粒径、形状、取向、排列、有序度等)和微观结构(表面形貌、内部亚结构)都十分敏感,特别是对亚波长尺度以下的超光学分辨结构特征敏感[21]. 通过缪勒矩阵分解[22],可以将缪勒矩阵分解为一组代表明确物理过程的子矩阵,进而获得一组具有明确物理意义的偏振参数,即散射退偏、相位延迟、线性相位延迟、二向色性. 缪勒矩阵变换[23-24]从特定样本偏振行为分析出发,获得一组具有物理意义的偏振参数,这些偏振参数可以提供样品微观结构信息. 本研究使用的偏振参数包含有 $ D $$ t $以及 $ b $等在内的34个偏振参数,它们都是旋转不变量. 其中 $ D $表示二向色性, $ t $表示各向异性, $ b $为线性相位延迟,其他偏振参数的含义可参考文献[21]~[24].

1.2. 缪勒矩阵显微镜

在商用透射式显微镜上添加起偏器(polarization state generator, PSG)模块和检偏器(polarization state analyzer, PSA)模块构成缪勒矩阵显微镜[17,25],其结构如图1所示. PSG由固定角度的线偏振片P1和可旋转的四分之一波片R1构成. R1安装在电动旋转平台上,旋转R1的角度可以得到不同偏振态的照明光. PSA由2个基于焦平面划分的线偏振相机(DoFP CCD)、1个50∶50非偏振分光棱镜和1个固定角度的四分之一波片R2构成. 穿过样品的透射光被非偏振分光棱镜分成2份,一份先经过R2再照射到线偏振相机DoFP CCD1上,另一份直接照射到线偏振相机DoFP CCD2上. 2个线偏振相机搭配四分之一波片组成的结构在经过校准后可以测量待测光的偏振态[17].

图 1

图 1   缪勒矩阵显微镜结构图

Fig.1   Schematic of Mueller matrix microscope


PSG调制发光二极管(光源波长λ=514 nm)发出的照明光偏振态,PSA检测穿过样品的透射光得出透射光斯托克斯向量. 根据文献[26]的研究结论,令R1旋转到4个特定的角度(±45°和±19.6°)进行起偏,每转动到其中的一个角度时2个线偏振相机进行数据采集,共进行4次采集. PSG先后产生4组不同偏振态的照明光,其斯托克斯向量组成4×4矩阵 ${\boldsymbol{S}}_{\mathrm{P}\mathrm{S}\mathrm{G}}$;PSA相对应地得到4组透射光斯托克斯向量,组成4×4矩阵 ${\boldsymbol{S}}_{\mathrm{P}\mathrm{S}\mathrm{A}}$. 样品的缪勒矩阵计算式为

$ \begin{array}{c}{\boldsymbol{M}}_{\mathrm{S}}={\boldsymbol{S}}_{\mathrm{P}\mathrm{S}\mathrm{A}}\times {{\boldsymbol{S}}_{{\rm{PSG}}}}^{ - 1}.\end{array} $

式中: ${{\boldsymbol{S}}_{{\rm{PSG}}}}^{ - 1}$为矩阵 ${\boldsymbol{S}}_{\mathrm{P}\mathrm{S}\mathrm{G}}$的逆运算. 每个像素点都有1个缪勒矩阵,对于样品而言,利用缪勒矩阵显微镜和式(2),可以得到缪勒矩阵图像,它由16个缪勒矩阵阵元图像组成,每个阵元图像大小相同,并且每个阵元图像的像素坐标对应着相同的样品空间位置. 每个颗粒物像素点均由其坐标对应的缪勒矩阵计算得到1×34的偏振参数数组(polarimetry basis parameters array, PBPA)来表示,所有颗粒物像素点的PBPA用于构成分类所需的数据集.

1.3. 样品

实验用微塑料分别是聚氯乙烯(PVC)和尼龙6(PA6),购买自东莞市樟木头华创塑胶原料商行,均为白色粉末状. 单个颗粒物粒径约为1000目(13 μm),在水中会呈聚集状态,粒径不一. PVC的折射率为1.53,PA6的折射率为1.54. 这2种微塑料广泛分布于河流、湖泊、海洋[27]. 实验用微藻分别是多芒藻(Golenkinia)和衣藻(Chlamydomonas),购买自中国科学院淡水藻种库. 多芒藻细胞半径平均约为10 μm,细胞为球形,周围有纤细的刺毛;衣藻细胞半径平均约为5 μm,细胞为卵形,前端有2条等长的鞭毛. 微藻的折射率为1.36~1.45. 多芒藻多生活于湖泊、河流、水坑,可以快速积累油脂实现生物能源生产,可以用于污水处理[28]. 衣藻多生活于有机质丰富的小水体或潮湿的土表上,池塘、湖泊或河流中也常发现,是能够特异地对线粒体、叶绿体与核分别建立转化系统的生物,具有高研究价值[29].

各样品在缪勒矩阵显微镜4倍物镜(数值孔径为0.1,视场为2 mm,分辨率为每微米1.028个像素点)下测得的缪勒矩阵阵元 $ {M}_{11} $图像如图2所示,图像大小均为1992×2350. 图中,LREF为各图像的参考长度.

图 2

图 2   微塑料和微藻的光强图像

Fig.2   Images of light intensity of microplastics and microalgae


1.4. 数据处理方法

图2中颗粒物透射光比周围背景的光更暗,利用 $ {M}_{11} $将颗粒物从背景中分离;先将图像中的像素值用该图像的最大值归一化,然后将其中大于0.5的所有像素点都归为背景,其余像素点为颗粒物像素点,将同一个连通域内的颗粒物像素点算作1个颗粒物. 本研究采用2种数据处理方法:1)像素点法(pixel point method, PPM),2)平均值法(mean value method, MVM). PPM取颗粒物图像上所有的像素点,计算每个像素点的PBPA,所有像素点都归入数据集;MVM是将该颗粒物看成整体,先计算图像上每个像素的PBPA,再取平均值,1个颗粒物只有1个PBPA归入数据集. 不同PBPA计算方法对应的颗粒物类别的判别方法也不同. 采用像素点法的判别方法先利用分类模型输出所有像素点对应的颗粒物类别,如果被归于某类的像素点数最多,则将整块颗粒物归入该类;采用平均值法所对应的判别方法则是直接使用分类模型的输出结果作为整块颗粒物的类别.

前馈神经网络是典型的深度学习方法[30],也是成熟的监督工具,可以在大量变量中提取特征并实现高预测准确性. 本研究建立针对二分类的前馈神经网络模型并将其作为分类模型. 缪勒矩阵蕴含丰富的颗粒物信息,颗粒物的物理特征复杂、种间差异多样,为此采用前馈神经网络从缪勒矩阵数据中提取不同种颗粒物的差异特征,以实现颗粒物分类. 如图3所示,前馈神经网络分类模型包含输入层、一层隐藏层以及输出层. 输入层有34个单元 $ {I}_{1} \sim I _{34} $,分别对应PBPA的34个数组元素;隐藏层有8个神经元 $ {H}_{1} \sim H_8 $;输出层有2个单元 $ {O}_{1}、 O_{2} $,代表2种颗粒物的预测概率. $ {W}_{ij} $$ {I}_{i} $$ {H}_{j} $之间的权值, $ {V}_{jk} $$ {H}_{j} $$ {O}_{k} $之间的权值. 隐藏层净输入的和为

图 3

图 3   前馈神经网络模型示意图

Fig.3   Schematic diagram of feedforward neural network model


$ \begin{array}{c}{{\rm{NET}}}_{1}\left(j\right)=\displaystyle{\sum} _{i=1}^{34}{I}_{i}{W}_{ij}.\end{array} $

输出层的输入的和为

$ \begin{array}{c}{{\rm{NET}}}_{2}\left(k\right)=\displaystyle{\sum} _{j=1}^{6}{H}_{j}{V}_{jk}.\end{array} $

输入与输出的关系用权值联系在一起. 划分数据集的70%为训练集,15%为验证集,15%为测试集.

2. 实验结果

实验采集14个PVC的测量视野、8个PA6的测量视野,11个多芒藻的测量视野、4个衣藻的测量视野,每种颗粒物各获得1 100个. 对于采用像素点法计算PBPA的微塑料来说,其数据集的样本数均约为2.0×105个,对于采用图像平均值法计算PBPA的微塑料和微藻,其数据集样本数各约为1 100个.

从PVC、PA6、多芒藻和衣藻这4个类别的颗粒物样品的缪勒矩阵图像中获取单个颗粒物的图像信息,分析缪勒矩阵阵元的差异. 各类别颗粒物的单个颗粒物的缪勒矩阵图像组成如图4所示. 考虑到各种颗粒物大小不一,为了完整显示它们的结构特征,设定PVC的缪勒矩阵阵元图像大小为80×80,PA6的缪勒矩阵阵元图像大小为50×50,多芒藻的缪勒矩阵阵元图像大小为40×40,衣藻的缪勒矩阵阵元图像大小为30×30. 图中,VNOR为缪勒矩阵阵元的归一化值. 为了显示方便,对各类别颗粒物图像进行缩放,让它们合成的缪勒矩阵图像一样大,缪勒矩阵的对角阵元的值已减1. 可以看出,PVC和PA6均在 $ {M}_{22} $$ {M}_{33} $有明显的差异,表明这2种微塑料对光的退偏程度不同[31]. 实验微塑料的 $ {M}_{24} $$ {M}_{34} $$ {M}_{42} $$ {M}_{43} $同样有明显差异,反映了不同微塑料内部结构引起的双折射不同[31]. PVC的 $ {M}_{22} $$ {M}_{33} $差异大,表明该样品具有明显的各向异性[31]. 图中可以明显观察到单个微塑料颗粒内部阵元值分布差异较大,这是由于该颗粒由许多细小微塑料堆叠而成,在不同位置处,厚度的不同会导致其阵元值不同. 多芒藻对应的 $ {M}_{22} $$ {M}_{33} $在细胞的不同结构上表现出较大差异,表明多芒藻细胞内部不同部位的退偏特征较其他特征更加明显[31]. 由 $ {M}_{24} $$ {M}_{34} $$ {M}_{42} $$ {M}_{43} $阵元可以看出,多芒藻内部结构具有明显的双折射[31];由 $ {M}_{12} $$ {M}_{13} $$ {M}_{21} $$ {M}_{31} $阵元的取值可以看出,多芒藻内部结构的排列导致了二向色性分布的变化[19]. 上述4个类别样品对应的缪勒矩阵阵元有显著差异,反映出样品不同微观结构具有不同的偏振特征,因此可以根据这些特征来区分不同种类的颗粒物样品.

图 4

图 4   微塑料和微藻的缪勒矩阵图像

Fig.4   Mueller matrix images of microplastics and microalgae


2.1. 微塑料分类

微塑料的形状大小不一,当采用像素点法计算PBPA时,数据集对应的微塑料样本数为200 000个. 测试集样本数占总样本数的15%,将测试集数据作为分类模型的输入,得到微塑料分类对应的混淆矩阵,如图5(a)所示. 混淆矩阵的行表示实际类别,矩阵的列表示预测类别,对角线阵元的值表示预测准确的比例,越接近100%,分类效果越好. 混淆矩阵由大量测试集样本得到,保证了分类准确度[32]. 2种微塑料在纯样品实验中的分类效果图,如图5(b)、(c)所示,图中深色代表PVC,浅色代表PA6. 可以看到,在纯PVC样品的实验中,视野内共有35个微塑料颗粒,其中34个被准确识别;在纯PA6样品的实验中,视野内共有114个微塑料颗粒,其中107个被准确识别. 2类微塑料在水中混合时的分类效果图如图5(d)所示. 在混合实验中,颗粒物被分为2类,其比例与图5(b)、(c)的比例接近;可以看出,2种微塑料的形态、大小变化范围很大,并且微塑料的聚集程度不同,仅凭图像难以得知微塑料种类. 由大量测试集样本得到的混淆矩阵,保证了缪勒矩阵数据可以准确地进行微塑料种类的区分,因此图5(d)混合样品中的2种微塑料被准确地识别出来是可信的.

图 5

图 5   聚氯乙烯和尼龙6的混淆矩阵和分类效果图

Fig.5   Confusion matrix and classification result of PVC and PA6


2.2. 微藻分类

微藻形状单一,且细胞内部结构丰富,当采用平均值法计算PBPA时,数据集对应的微藻样本数为1100个. 微藻分类对应的混淆矩阵如图6(a)所示,多芒藻和衣藻的预测准确率分别为87.3%和90.2%. 如图6(b)所示为2种微藻在水中混合时的分类效果图,包含31个多芒藻,171个衣藻. 图中,红色代表多芒藻,黑色代表衣藻. 27个多芒藻细胞被准确识别,156个衣藻被准确识别,准确度分别是87.1%和91.2%,与混淆矩阵接近. 衣藻普遍小于多芒藻[28-29],对比图2(c)和图2(d)可以得出类似结论,因此在图6(b)的混合样品中,可以通过观察图像中颗粒物大小来区分二者,但是这种判别方式可能存在误差.

图 6

图 6   多芒藻和衣藻的混淆矩阵和分类效果图

Fig.6   Confusion matrix and classification result of Golenkinia and Chlamydomona


2.3. 微塑料与微藻分类

在考察微塑料和微藻的分类情况时,为了便于与真值进行比较,实验选择图像特征比较明显的微塑料PVC和圆形的多芒藻作为样品. 此时,微塑料和微藻均采用平均值法计算各自的PBPA,其数据集样本数各1 100个,其混淆矩阵如图7(a)所示. 可以看出,2类颗粒物的分类准确度大于85%,分类准确度较高,其中微塑料的分类准确度大于微藻的分类准确度. 为了模拟自然水体中的情形,实验时将2种颗粒物在水中混合后测量其缪勒矩阵图像,分类效果图如图7(b)所示. 利用图像特征认定颗粒物类别作为真值,其中认定圆形颗粒物为多芒藻,形状不规则的颗粒物则为PVC. 图中包含26个PVC,63个多芒藻,分类效果图中蓝色代表PVC,红色代表多芒藻. 其中,21个PVC被准确识别,58个多芒藻细胞被准确识别,微塑料和微藻的分类准确度分别为80.8%、92.1%,与混淆矩阵接近. 虽然图7中采用图像特征区别显著的2种颗粒物作为例子,方便评估分类结果的准确性,但是自然水体中颗粒物种类繁多、形态复杂,区分不同颗粒物难度很大. 如图5(d)中2种不同微塑料混合时,仅凭图像特征难以区分二者,还需要颗粒物的偏振特征(缪勒矩阵).

图 7

图 7   聚氯乙烯和多芒藻的混淆矩阵以及分类效果图

Fig.7   Confusion matrix and classification result of PVC and Golenkinia


图8所示为对PVC、PA6、多芒藻、衣藻4种颗粒物进行四分类的混淆矩阵. 各类颗粒物的分类准确度差异很大,比如对2种微塑料的分类准确度大于90%,衣藻的分类准确度大于80%,但是多芒藻的分类准确度小于80%. 可以看出,多芒藻与PVC之间的误判较高,这与图7(a)中混淆矩阵的结果类似;图6(a)多芒藻与衣藻之间也有一定程度的误判. 综合来看,多芒藻的分类准确度较低,但是4类颗粒物的平均分类准确度大于86%,说明缪勒矩阵显微方法可以较准确地识别不同的颗粒物.

图 8

图 8   4种颗粒物四分类的混淆矩阵

Fig.8   Confusion matrix corresponding to four classifications of four particles


综合图5~8的结果可以看出,缪勒矩阵图像可以准确地对水中微塑料和微藻进行分类. 分类准确度受制于PBPA的计算方法、颗粒物种类的真值影响;缪勒矩阵图像的准确测量也可能关乎分类效果.

3. 讨 论

结合实验结果可知,由缪勒显微镜采集到的数据算出的缪勒矩阵及其演化的偏振参数对颗粒物的物理性质具有较强表征能力,它是比传统显微成像更强有力的分析工具. 然而,影响颗粒物分类效果的因素有很多,依旧有许多值得探讨的地方.

3.1. 数据处理方法的选择

图6是采用平均值法计算PBPA对2种微藻进行分类得到的结果,获得了较好的分类效果. 当采用像素点法计算PBPA时,对应的混淆矩阵如图9所示. 可以看到,相较图6(a),像素点法对应的准确度下降了9.2个百分点.

图 9

图 9   2种微藻采用像素点法时分类后得到的混淆矩阵

Fig.9   Confusion matrix obtained after classification of two microalgae using pixel point method


分别采用像素点法和平均值法分析数据集中的1 100个多芒藻样本的PBPA,其偏振参数 $ D $$ t $的值分布情况如图10所示. NNOR为偏振参数分布数量的归一化值. 采用像素点法时, $ D $的标准差为0.031 2, $ t $的标准差为0.018 4. 采用平均值法时, $ D $的标准差为0.019 2, $ t $的标准差为0.006 3. 可以看到,采用平均值法可以将偏振参数的值分布范围缩小. 微藻内部结构复杂,内部结构的偏振特征差异较大,对整个细胞偏振参数取平均值,可以将这些差异压制,有利于突出不同微藻之间的差异,因此分类效果更好.

图 10

图 10   采用不同数据处理方法时2种偏振参数值的分布图

Fig.10   Distribution diagram of two polarimetry basis parameters with different data processing methods


3.2. 运动伪影

在水环境中的颗粒物,尤其是微藻容易发生旋转和翻滚. 部分偏振参数对颗粒物的运动较为敏感,缪勒矩阵显微镜在采集图像数据时须配合电机的转动,用时18 s,过程中要求视野下的颗粒物保持静止不动,以便采集到最为准确的数据. 如图11所示为有运动伪影和无运动伪影时PVC的 $ {M}_{11} $图像. 有运动伪影和无运动伪影的实验条件不变,区别仅在于水流动的剧烈程度,严格来讲,图11(b)中的颗粒物图像依然存在运动伪影,但成像效果明显好于图11(a)的颗粒物图像.

图 11

图 11   有运动伪影和无运动伪影时聚氯乙烯的光强图像

Fig.11   Images of light intensity of PVC with or without motion artifacts


表1所示为同一块PVC在有运动伪影和无运动伪影时对应的偏振参数 $ D $$ t $$ b $的均值和标准差. 表中, $ {D}_{\mathrm{M}} $为偏振参数 $ D $的均值, $ {D}_{\mathrm{S}\mathrm{D}} $为偏振参数 $ D $的标准差, $ {t}_{\mathrm{M}} $为偏振参数 $ t $的均值, $ {t}_{\mathrm{S}\mathrm{D}} $为偏振参数 $ t $的标准差, $ {b}_{\mathrm{M}} $为偏振参数 $ b $的均值, $ {b}_{\mathrm{S}\mathrm{D}} $为偏振参数 $ b $的标准差. 可以看到,存在运动伪影时,各偏振参数的平均值都发生较大变化. 从偏振参数的标准差变化情况来看,运动伪影会导致数据变得离散,使分类效果变差. 在实验过程中,通过抑制细胞或颗粒物的运动、更快的成像和更复杂的图像配准技术,可以减少由运动伪影引起的误差. 可以通过添加固定剂(如福尔马林溶液)来抑制微藻的自身运动,或者在盖玻片边缘用蜡封抑制液体挥发来限制颗粒运动,也可以通过减少整个显微镜台面的振动或晃动来减少颗粒物的运动.

表 1   有运动伪影和无运动伪影时聚氯乙烯偏振参数的均值和标准差表

Tab.1  Mean and standard deviation of polarimetry basis parameters of PVC with or without motion artifacts

运动伪影 DM DSD tM tSD bM bSD
0.628 8 0.249 3 0.273 4 0.194 3 0.791 3 0.257 2
0.027 5 0.013 0 0.027 9 0.014 8 0.992 0 0.0195

新窗口打开| 下载CSV


3.3. 显微镜对焦的影响及应对方法

由于颗粒物在水中位置分布不同、自身厚度不同等因素,实验时无法做到对视野中所有颗粒物精确对焦,尝试采集PVC和PA6的多个焦平面的数据,再对多组数据的每个像素点的偏振参数进行取均值处理. 以单个PVC颗粒为例,采集3种不同对焦情况下的图像(F1、F2、F3),并取3张图像每个像素点的均值合成新的图像(F4). 3种不同对焦情况下偏振参数 $ D $$ t $的值分布情况如图12所示. 在对焦情况F1下, $ D $的标准差为0.0259, $ t $的标准差为0.0201;在对焦情况F2下, $ D $的标准差为0.0748, $ t $的标准差为0.0331;在对焦情况F3下, $ D $的标准差为0.0278, $ t $的标准差为0.0207;对3种对焦情况下的数据取平均后, $ D $的标准差为0.0308, $ t $的标准差为0.0163. 可以看到,对3种聚焦下的数据取均值后,可以减小单次随机对焦带来的不利影响,有利于分类.

图 12

图 12   在不同对焦情况下2种偏振参数值的分布图

Fig.12   Distribution diagram of two polarimetry basis parameters in different focusing situations


4. 结 语

本研究基于缪勒矩阵显微镜对2种微塑料和2种微藻进行分类探测. 使用缪勒矩阵显微镜采集样品缪勒矩阵图像数据,得到颗粒物的偏振参数. 利用深度学习工具实现对微塑料、微藻以及微塑料和微藻的分类识别,结果显示,分类准确率均超过80%,表明源于缪勒矩阵图像的偏振参数能够有效、高通量地实现对水中微塑料和微藻的分类和识别. 本研究讨论了不同数据处理方法、样品运动、物镜的对焦对缪勒显微镜所采集数据的准确性的影响,但只在进行了微塑料与微藻的简单分类实验后展示了方法的有效性. 在后续工作中,1)将探索更多的偏振参数,从中选择合适、有效的偏振参数进行多分类实验;2)将对自然水体中颗粒物开展实验研究,摸索可以直接用于现场水样检测的方法.

参考文献

周倩, 章海波, 李远, 等

海岸环境中微塑料污染及其生态效应研究进展

[J]. 科学通报, 2015, 60 (33): 3210- 3220

DOI:10.1360/N972015-00714      [本文引用: 1]

ZHOU Qian, ZHANG Hai-bo, LI Yuan, et al

Progress on microplastics pollution and its ecological effects in the coastal environment

[J]. Chinese Science Bulletin, 2015, 60 (33): 3210- 3220

DOI:10.1360/N972015-00714      [本文引用: 1]

ROCHMAN C M

Microplastics research: from sink to source

[J]. Science, 2018, 360 (6384): 28- 29

DOI:10.1126/science.aar7734      [本文引用: 1]

ZHANG K, SHI H, PENG J, et al

Microplastic pollution in China's inland water systems: a review of findings, methods, characteristics, effects, and management

[J]. Science of the Total Environment, 2018, 630: 1641- 1653

DOI:10.1016/j.scitotenv.2018.02.300      [本文引用: 1]

GOJKOVIC Z, SKROBONJA A, FUNK C, et al

The role of microalgae in the biogeochemical cycling of methylmercury (MeHg) in aquatic environments

[J]. Phycology, 2022, 2 (3): 344- 362

DOI:10.3390/phycology2030019      [本文引用: 1]

李雪静, 张璐瑶, 乔明, 等

藻类生物燃料研究开发进展

[J]. 中外能源, 2009, 14 (4): 23- 26

[本文引用: 1]

LI Xue-jing, ZHANG Lu-yao, QIAO Ming, et al

Progress in algae biofuel research and development

[J]. Sino-Global Energy, 2009, 14 (4): 23- 26

[本文引用: 1]

孔繁翔, 马荣华, 高俊峰, 等

太湖蓝藻水华的预防、预测和预警的理论与实践

[J]. 湖泊科学, 2009, 21 (3): 314- 328

DOI:10.3321/j.issn:1003-5427.2009.03.002      [本文引用: 1]

KONG Fan-xiang, MA Rong-hua, GAO Jun-feng, et al

The theory and practice of prevention, forecast and warning on cyanobacteria bloom in Lake Taihu

[J]. Journal of Lake Sciences, 2009, 21 (3): 314- 328

DOI:10.3321/j.issn:1003-5427.2009.03.002      [本文引用: 1]

王建立, 刘欣悦

智能光学的概念及发展

[J]. 中国光学, 2013, 6 (4): 437- 448

[本文引用: 1]

WANG Jian-li, LIU Xin-yue

Concept and development of smart optics

[J]. Chinese Optics, 2013, 6 (4): 437- 448

[本文引用: 1]

葛宝臻, 李文超, 马云峰, 等

基于四象限探测的激光粒度仪自动对中技术

[J]. 光学精密工程, 2010, 18 (11): 2384- 2389

[本文引用: 1]

GE Bao-zhen, LI Wen-chao, MA Yun-feng, et al

Automatic centering of laser partical size analyzers based on four-quadrant construction

[J]. Optics and Precision Engineering, 2010, 18 (11): 2384- 2389

[本文引用: 1]

DE CARVALHO L A S, BARBOSA C C F, DE MORAES NOVO E M, et al

Implications of scatter corrections for absorption measurements on optical closure of Amazon floodplain lakes using the spectral absorption and attenuation meter (AC-S-WETLabs)

[J]. Remote Sensing of Environment, 2015, 157: 123- 137

DOI:10.1016/j.rse.2014.06.018      [本文引用: 1]

BRIGHT C, MAGER S, HORTON S

Response of nephelometric turbidity to hydrodynamic particle size of fine suspended sediment

[J]. International Journal of Sediment Research, 2020, 35 (5): 444- 454

DOI:10.1016/j.ijsrc.2020.03.006      [本文引用: 1]

王义强, 林方睿, 胡睿, 等

大视场光学显微成像技术

[J]. 中国光学, 2022, 15 (6): 1194- 1210

[本文引用: 1]

WANG Yi-qiang, LIN Fang-rui, HU Rui, et al

Large field-of-view optical microscopic imaging technology

[J]. Chinese Optics, 2022, 15 (6): 1194- 1210

[本文引用: 1]

LI X, LIAO R, ZHOU J, et al

Classification of morphologically similar algae and cyanobacteria using Mueller matrix imaging and convolutional neural networks

[J]. Applied Optics, 2017, 56 (23): 6520- 6530

DOI:10.1364/AO.56.006520      [本文引用: 2]

孙军, 宋煜尧, 刘海娇

海洋浮游植物快速鉴定与监测技术

[J]. 海洋科学进展, 2022, 40 (4): 701- 716

[本文引用: 1]

SUN Jun, SONG Yu-yao, LIU Hai-jiao

State-of-the-art rapid identification and monitoring techniques for marine phytoplankton

[J]. Advances in Marine Science, 2022, 40 (4): 701- 716

[本文引用: 1]

ADAN A, ALIZADA G, KIRAZ Y, et al

Flow cytometry: basic principles and applications

[J]. Critical Reviews in Biotechnology, 2017, 37 (2): 163- 176

DOI:10.3109/07388551.2015.1128876      [本文引用: 2]

DASHKOVA V, MALASHENKOV D, POULTON N, et al

Imaging flow cytometry for phytoplankton analysis

[J]. Methods, 2017, 112: 188- 200

DOI:10.1016/j.ymeth.2016.05.007      [本文引用: 1]

罗海波, 张俊超, 盖兴琴, 等

偏振成像技术的发展现状与展望(特邀)

[J]. 红外与激光工程, 2022, 51 (1): 20210987

[本文引用: 1]

LUO Hai-bo, ZHANG Jun-chao, GAI Xing-qin, et al

Development status and prospects of polarization imaging technology (Invited)

[J]. Infrared and Laser Engineering, 2022, 51 (1): 20210987

[本文引用: 1]

HUANG T, MENG R, QI J, et al

Fast Mueller matrix microscope based on dual DoFP polarimeters

[J]. Optics Letters, 2021, 46 (7): 1676- 1679

DOI:10.1364/OL.421394      [本文引用: 3]

PIERANGELO A, NAZAC A, BENALI A, et al

Polarimetric imaging of uterine cervix: a case study

[J]. Optics Express, 2013, 21 (12): 14120- 14130

DOI:10.1364/OE.21.014120      [本文引用: 1]

LIU Z, LIAO R, WAN J, et al

Polarization staining and high-throughput detection of marine microalgae using single cell average Mueller matrices

[J]. Optik, 2019, 180: 84- 90

DOI:10.1016/j.ijleo.2018.11.076      [本文引用: 3]

董洋, 张冯頔, 姚悦, 等

基于全偏振成像的数字病理方法

[J]. 中国科学: 生命科学, 2023, 53 (4): 480- 504

DOI:10.1360/SSV-2021-0412      [本文引用: 1]

DONG Yang, ZHANG Feng-di, YAO Yue, et al

Mueller microscopy for digital pathology

[J]. Scientia Sinica Vitae, 2023, 53 (4): 480- 504

DOI:10.1360/SSV-2021-0412      [本文引用: 1]

李嘉晋, 廖然, 马辉

海洋颗粒物的原位细致分类、应用与展望

[J]. 光学学报, 2022, 42 (6): 0600005

[本文引用: 2]

LI Jia-jin, LIAO Ran, MA Hui

In situ fine classification, application, and expectation of marine particles

[J]. Acta Optica Sinica, 2022, 42 (6): 0600005

[本文引用: 2]

LU S, CHIPMAN R A

Interpretation of Mueller matrices based on polar decomposition

[J]. Journal of Optical Society of America A, 1996, 13 (5): 1106- 1113

DOI:10.1364/JOSAA.13.001106      [本文引用: 1]

HE H, CHANG J, HE C, et al. Transformation of full 4×4 Mueller matrices: a quantitative technique for biomedical diagnosis [J]. Dynamics and Fluctuations in Biomedical Photonics XIII. San Francisco: [s.n.], 2016. .

[本文引用: 1]

HE H, ZENG N, DU E, et al

A possible quantitative Mueller matrix transformation technique for anisotropic scattering media

[J]. Photonics and Lasers in Medicine, 2013, 2 (2): 129- 137

[本文引用: 2]

黄彤宇, 孟若愚, 赵千皓, 等

模块化全偏振显微镜

[J]. 中国激光, 2021, 48 (15): 1517002

DOI:10.3788/CJL202148.1517002      [本文引用: 1]

HUANG Tong-yu, MENG Ruo-yu, ZHAO Qian-hao, et al

Modular full-polarization microscope

[J]. Chinese Journal of Lasers, 2021, 48 (15): 1517002

DOI:10.3788/CJL202148.1517002      [本文引用: 1]

CHANG J, HE H, WANG Y, et al

Division of focal plane polarimeter-based 3×4 Mueller matrix microscope: a potential tool for quick diagnosis of human carcinoma tissues

[J]. Journal of Biomedical Optics, 2016, 21 (5): 56002

DOI:10.1117/1.JBO.21.5.056002      [本文引用: 1]

徐沛, 彭谷雨, 朱礼鑫, 等

长江口微塑料时空分布及风险评价

[J]. 中国环境科学, 2019, 39 (5): 2071- 2077

DOI:10.3969/j.issn.1000-6923.2019.05.035      [本文引用: 1]

XU Pei, PENG Gu-yu, ZHU Li-xin, et al

Spatial-temporal distribution and pollution load of microplastics in the Changjiang Estuary

[J]. China Environmental Science, 2019, 39 (5): 2071- 2077

DOI:10.3969/j.issn.1000-6923.2019.05.035      [本文引用: 1]

聂昌亮. 多芒藻高效生长, 油脂积累及其处理校园生活污水的优化研究[D]. 济南: 山东大学, 2020

[本文引用: 2]

NIE Chang-liang. Optimizing grouth, lipid synthesis and campus domestic sewage treatment for Golenkinia SDEC-16 [D]. Jinan: Shandong University, 2020.

[本文引用: 2]

谢传晓, 韩伟, 余增亮

模式生物衣藻及其研究进展

[J]. 遗传, 2003, 25 (3): 350- 354

DOI:10.3321/j.issn:0253-9772.2003.03.027      [本文引用: 2]

XIE Chuan-xiao, HAN wei, YU Zeng-liang

Progress of Chlamydomonas as a model organism

[J]. Hereditas, 2003, 25 (3): 350- 354

DOI:10.3321/j.issn:0253-9772.2003.03.027      [本文引用: 2]

ZHANG D, ZHANG W, HUANG W, et al

Upscaling of surface soil moisture using a deep learning model with VIIRS RDR

[J]. ISPRS International Journal of Geo-Information, 2017, 6 (5): 130

DOI:10.3390/ijgi6050130      [本文引用: 1]

沈元星, 姚悦, 何宏辉, 等

非标记、定量化穆勒矩阵偏振成像在辅助临床诊断中的应用

[J]. 中国激光, 2020, 47 (2): 0207001

DOI:10.3788/CJL202047.0207001      [本文引用: 5]

SHEN Yuan-xing, YAO Yue, HE Hong-hui, et al

Mueller matrix polarimetry: a label-free, quantitative optical method for clinical diagnosis

[J]. Chinese Journal of Lasers, 2020, 47 (2): 0207001

DOI:10.3788/CJL202047.0207001      [本文引用: 5]

孔英会, 景美丽

基于混淆矩阵和集成学习的分类方法研究

[J]. 计算机工程与科学, 2012, 34 (6): 111- 117

[本文引用: 1]

KONG Ying-hui, JING Mei-li

Research of the classification method based on confusion matrixes and ensemble learning

[J]. Computer Engineering and Science, 2012, 34 (6): 111- 117

[本文引用: 1]

/