Perl 5.0,GetUni程序包," /> Perl 5.0,GetUni程序包,"/> 电子基因表达谱分析平台的建立及其应用
Please wait a minute...
浙江大学学报(工学版)
J4  2006, Vol. 40 Issue (2): 186-191    
论文     
电子基因表达谱分析平台的建立及其应用
徐静（1979-），女，浙江杭州人，硕士生，主要从事肿瘤分子病理学及生物信息学研究. E-mail: X_J_1998@126.com
 全文: PDF 
摘要：

建立了利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)序列表达标签(EST)数据库(dbEST)电子EST构建特定组织电子基因表达谱的生物信息学分析平台，并利用该平台构建了人正常结直肠组织电子基因表达谱.从dbEST获取人正常结直肠电子EST 20 370条，利用自行开发的GetUni程序包，与下载于本地的人类同一基因转录子(UniGene)数据库匹配，获得了含有4 196个非冗余基因的正常结直肠组织电子基因表达谱.经在线基因组分析工具(Webgestalt)证实，表达谱中97%的基因在结直肠组织中表达，除涉及细胞生长、发育、分化、凋亡等基因外，还包括人正常结直肠功能特异性基因；3%未得到Webgestalt证实的基因经手工回溯查找，确证其EST均来自人正常结直肠.GetUni程序包是一个高效准确的高通量电子EST数据分析平台，构建的人正常结直肠组织基因表达谱将为结直肠特异性标志物的筛选提供大量数据.
关键词： dbEST;  UniGene;  结直肠;  基因表达谱;  生物信息学;  Perl 5.0')" href="#">Perl 5.0;  GetUni程序包    
出版日期: 2006-02-25
基金资助:

国家自然科学基金资助项目(30371605,30370636)
作者简介: 徐静（1979-），女，浙江杭州人，硕士生，主要从事肿瘤分子病理学及生物信息学研究. Email: X_J_1998@126.com
服务　　
把本文推荐给朋友
加入引用管理器
E-mail Alert
RSS
作者相关文章　　
徐静
吕炳建
张昊
陈俭
朱益民
谷雪梅
来茂德

引用本文:

徐静 吕炳建 张昊 陈俭 朱益民 谷雪梅 来茂德. 电子基因表达谱分析平台的建立及其应用[J]. J4, 2006, 40(2): 186-191.

XU Jing, LV Bing-Jian, ZHANG Hao, CHEN Jian, SHU Yi-Min, GU Xue-Mei, LAI Mao-De. . J4, 2006, 40(2): 186-191.

链接本文:

http://www.zjujournals.com/xueshu/eng/CN/    或    http://www.zjujournals.com/xueshu/eng/CN/Y2006/V40/I2/186

No related articles found!