鸡传染性支气管炎病毒河南流行毒株S1基因的变异分析
经鸡胚接种、反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR) 、气管环培养等方法从河南不同地区发病鸡群中先后共分离、鉴定出7株鸡传染性支气管炎病毒( IBV) .应用RT-PCR 方法对7株病毒以及IBVH120 疫苗株的S1 基因全序列进行扩增,并对其进行克隆测序及序列分析.结果显示:8株IBV 的S1基因全长分为4类,分别是1632、1620、1617和1611 bp ;序列相互之间存在多位点变异,同时存在型特异性的插入和缺失;其S 蛋白裂解位点序列模式有HRRRR 、RRFRR 和RRSRR 3种;同源性及遗传进化分析显示Jin-13为呼吸型毒株,YI 为ArkDPI 型肾型毒株,HN/SG 株与国内其他肾型分离株亲缘关系均较远;河南肾型分离株HN/HL 、XP/1/09 、XP/3 、WZL 与山东肾型分离株之间的同源性较高且其亲缘关系最近,而与河南HN99株的亲缘关系较远.说明河南地区存在不同的IBV 流行毒株,这些流行毒株在主要保护性抗原蛋白S1 基因上发生了一定的变异.