柑橘黄龙病菌核糖体蛋白基因的多态性及系统发育分析
通过 PCR 扩增6 个不同地区柑橘黄龙病 (citrus huanglongbing ,HLB) 病原菌的核糖体蛋白基因 , 采用4种不同的限制性内切酶对 PCR 产物进行限制性片段长度多态性 (RFLP) 分析 ; 并对核糖体蛋白基因克隆和测序后 , 使用 DNAman 和 NCBI Blast 等软件对基因序列进行比对分析 , 并通过软件 Mega4.1构建其系统发育树 . 结果表明 : 6个分离物核糖体蛋白基因的 RFLP 指纹图谱有所差异 , 表现出一定的多态性 ; 不同分离物核糖体蛋白基因的核酸序列和氨基酸序列均存在差异 , 但相互之间同源性很高 ,其中核酸序列与数据库中亚洲种 ( Candidatus Liberibacter asiaticus) 的同源性高达99% ~100% , 与非洲种 ( Ca.L.africanus) 的同源性为85% , 与美洲种 ( Ca.L.americanus) 的同源性为77% ~80% ; 系统发育分析显示所有的 Ca.L.asiaticus 亲缘关系极近 , 归为一个类群 , 而后与 Ca.L.africanus 和 Ca.L.americanus 组成韧皮部杆菌属 ( Candidatus Liberibacter) 一个大的类群 .