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浙江大学学报（农业与生命科学版）
浙江大学学报(农业与生命科学版)  2004, Vol. 30 Issue (2): 133-140    
论文     
一个新的水稻TE的克隆及其与CACTA转座子结构的比较
田平芳　 王国栋　 李群　 李德葆　 何祖华
田平芳（浙江大学,生物技术研究所,浙江,杭州,310029;中国科学院上海生命科学研究院,上海植物生理生态研究所,SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032）　　　　　　
王国栋（中国科学院上海生命科学研究院,上海植物生理生态研究所,SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032;华东师范大学,生物系,上海,200062）　　　　　　
李群（中国科学院上海生命科学研究院,上海植物生理生态研究所,SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032）　　　　　　
李德葆（浙江大学,生物技术研究所,浙江,杭州,310029）　　　　　　
何祖华（浙江大学,生物技术研究所,浙江,杭州,310029;中国科学院上海生命科学研究院,上海植物生理生态研究所,SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032）
 全文: PDF(474 KB)  
摘要： 对水稻受稻瘟病菌诱导的新因子Rim2的基因组结构进行了研究.以Rim2 cDNA片段作探针, 筛选水稻BAC文库并对其亚克隆, 获得了一个基因组DNA克隆Rim2-569.序列分析表明, Rim2-569序列具备Class 2 转座子的基本结构特征.它两端具有完整的末端颠倒重复(TIRs), 若干正向和反向的亚末端重复 (STRs) , 以及插入位点3 bp的同向重复.它TIRs上的保守序列CACTG有别于以往报道的CACTA转座子.该因子包含一个开读框, 其预测蛋白与CACTA转座子编码的TNP2、TNPD等转座酶有低程度的同源性.该因子没有能够编码类似TNP1/TNPA 的DNA结合蛋白的开读框.Southern杂交显示, Rim2因子在多个不同起源的水稻品种上广泛存在,连同检索结果,证明该家族具有很多拷贝.上述特点表明, 该因子属于一个与CACTA转座子有一定差异的新的转座子大家族.
出版日期: 2004-03-15
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引用本文:

田平芳　 王国栋　 李群　 李德葆　 何祖华. 一个新的水稻TE的克隆及其与CACTA转座子结构的比较 [J]. 浙江大学学报(农业与生命科学版), 2004, 30(2): 133-140.

链接本文:

https://www.zjujournals.com/agr/CN/Y2004/V30/I2/133

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