通过多基因组比较的方法在5种绿球蓝细菌中识别基因组岛
为探索水平基因转移在绿球蓝细菌基因组多样性中的作用,5个高光适应性绿球蓝细菌基因组被比较。先用BLASTP两两最佳匹配搜索和基因位置保守性的方法预测直系同源基因,并进一步计算 每个基因组中所有基因在其他4种绿球蓝细菌基因组中直系同源基因的数量,从而达到识别外源基因的目的;而基因组岛是指由1个或几个连续外源基因组成的区域。结果表明:在5个绿球蓝细菌基因组 中共识别出了16至52个不等的基因组岛,它们中的许多基因在病毒基因组或富含病毒的环境样本中 都有同源基因。以上这些结果显示,在绿球蓝细菌中,病毒可能介导了基因的水平转移,从而导致了基因组的多样性 。