鮸鱼全长均一化cDNA 文库的构建及EST 序列信息学分析
采用双链特异性核酸酶(DSN)均一化技术与SMART 技术相结合,以经过鳗弧菌感染后获得的鮸鱼脾脏材料构建均一化全长cDNA 文库.该原始文库约含有7.5 × 106个重组子,插入片段在1 ~ 3kb 之间,文库滴度为1.6 × 106 CFU.mL - 1 .从文库中随机挑选5952个克隆进行测序,共获得5053条表达序列标签( EST) ,其中高质量序列4609条.对序列进行组装后,发现非冗余基因序列3221条,重叠群656个,单拷贝序列2565条,冗余率为30.11%.对全部序列分析后发现,其平均读长为550bp ,大部分序列长度在500 ~ 599 bp 之间,GC 含量大部分分布于40% ~ 60%之间.1397个基因能够进行GO(geneontology) 功能注释,并初步筛选到大量与免疫功能相关的蛋白家族及功能域的基因序列,为进一步鮸鱼分子育种奠定了基础.