基于蝙蝠算法的蛋白质网络功能模块检测

徐嘉豪,冀俊忠,杨翠翠

Functional modules detection based on bat algorithm in protein-protein interaction networks

Jia-hao XU,Jun-zhong JI,Cui-cui YANG

表 3 7种算法在5个数据集上的实验结果

Tab.3 Experimental results of seven algorithms on five datasets

算法 数据集 结果 模块数 模块平均大小 Na≥0.2 Nb≥0.2 BA-FMD Gavin 215 6.48 111 198 DIPcore 416 6.01 163 252 Krogan 521 6.93 135 190 Collins 291 5.45 148 244 BioGRID 731 6.02 218 295 NACO-FMD Gavin 115 7.31 80 163 DIPcore 311 5.00 125 209 Krogan 183 2.81 77 115 Collins 254 3.58 129 162 BioGRID 195 3.21 72 92 BFO-FMD Gavin 146 6.57 94 176 DIPcore 302 6.29 153 246 Krogan 189 7.04 80 145 Collins 268 5.63 148 252 BioGRID 281 5.73 140 220 Jerarca Gavin 259 5.39 99 174 DIPcore 583 4.34 151 230 Krogan 727 4.05 101 167 Collins 385 4.21 150 245 BioGRID 1 313 4.30 98 156 COACH Gavin 324 2.34 122 197 DIPcore 381 2.87 136 155 Krogan 579 9.29 247 190 Collins 251 18.02 176 199 BioGRID 1 507 22.85 410 264 ClusterONE Gavin 243 5.92 102 156 DIPcore 269 4.13 115 157 Krogan 240 4.68 100 139 Collins 203 6.44 118 201 BioGRID 475 6.56 163 219 ClusterEPs Gavin 297 5.03 171 165 DIPcore 354 4.72 208 182 Krogan 494 6.62 297 178 Collins 173 9.82 132 170 BioGRID 822 5.50 396 252